אחד המוזיאונים המבוקרים ביותר באמסטרדם הוא מוזיאון של בית אנה פרנק. אנה פרנק היתה נערה יהודייה שנספתה בשואה. אנה כתבה היומן. היומן מתאר את התקופה שבה הסתתרה יחד עם משפחתה מרדיפות של היהודים על ידי הנאצים במחבוא בבית המשרדים של חברת אופקטה. הרבה יותר מאוחר יומן מתפרסם כספר, וזכה לפופולריות רבה ולתרגומים לעשרות שפות.
בבית אנה פרנק הסתתרו אנה ובני משפחתה, עד שהוסגרו לידי הנאצים והובלו למחנות ריכוז. חוץ מאב אף אחד מבני משפחה לא שרד שואה. לפני מלחמת העולם השניה הבית היה מפעל קטן ליצור פסנתרים. באחד המשרדים היתה קומת מסתור ובה היה ארון תיוק שדרכו ניתן היה להגיע לקומת מסתור. כשנתפסה משפחה נשלחה למחני ריכוז.
לאחר מלחמת העולם שניה, מקים אביה של אנה פרנק קרן לזכרה. חברה שבבעלותה היה מבנה תורמת אותו לקרן ונפתח בבניין זה מוזיאון לזכר אנה פרנק שמתאר רק חלק קטן מזועוות שנעשו ע"י הנצים.
המוזיאון מציג את המבנה המקורי המשוחזר, לרבות חדרי המחבוא. עוד במוזיאון מוצגים תרגומים שונים של יומנה של אנה פרנק.